En 1942, Karel, un jeune Tchèque réfugié à Londres, est parachuté au dessus de son village natal, Lidice, près de Prague. Il trouve refuge dans une grotte et s'efforce d'organiser le combat contre l'occupant nazi. Jarmila Hanka, une jeune villageoise, éprise du héros, lui offre son aide. Le procurateur d'Hitler pour la Bohême-Moravie, Reinhard Heydrich, fait régner la terreur sur toute la région. Aussi les villageois hésitent-ils à le contrarier. Mais un jour qu'Heydrich profane une procession mortuaire, souille un objet sacré et fait assassiner le prêtre local, nombre de paroissiens trouvent que la coupe est pleine. La révolte éclate...